После Чернобыльской аварии в 1986 г. сооружение всех новых АЭС в стране было остановлено и все проекты ядерных блоков были направлены на дополнительное рассмотрение по обоснованию безопасности и, при необходимости, корректировку. (Также были остановлены начатые работы по сооружению завода «Комплекс-300» по производству МОХ-топлива для быстрых реакторов).

В связи с Чернобыльской аварией, под эгидой Академии Наук была создана специальная комиссия по рассмотрению и анализу новых проектов ядерных энергетических установок. Основное замечание, которое выдвинула эта комиссия при рассмотрении проекта БН-800, касалось натриевого пустотного эффекта реактивности (НПЭР), а именно: его довольно значительной положительной величины при опустошении активной зоны от натрия. Выход из создавшегося положения был предложен специалистами ФЭИ по введению специальной «натриевой» полости в тепловыделяющую сборку активной зоны за счет удаления верхнего торцевого экрана. Для защиты механизмов, расположенных в поворотных пробках, от нейтронного излучения над натриевой полостью в тепло-выделяющей сборке (ТВС) помещается верхняя защита из карбида бора. В случае закипания натрия в активной зоне резко возрастает утечка нейтронов через натриевую полость, приводя к вводу отрицательной реактивности, доводя НПЭР до нулевого значения.

Для обоснования этого проектного решения были проведены многочисленные исследования, включая расчеты, эксперименты на критических сборках и международные бенчмарки с участием ведущих специалистов СССР, США, Франции, Японии, Германии, Великобритании.

В дальнейшем, в 90-х годах, продолжение строительства энергоблока сдерживалось сложной экономической ситуацией в стране. В этот период проект энергоблока БН-800 продолжал совершенствоваться, и к моменту возобновления его сооружения обрел лучшие свои свойства и характеристики, удовлетворяющие всем современным требованиям по безопасности. В начале 2000-х годов ФЭИ и ОКБМ провели большую работу по возобновлению сооружения реактора БН-800 при участии комитета по энергетике Государственной Думы. В результате в 2006 г. финансирование сооружения энергоблока с реактором БН-800 на Белоярской АЭС было включено отдельной строкой в Федеральную целевую программу «Развитие атомного энергопромышленного комплекса России в 2007–2010 гг. и на перспективу до 2015 г.».

Работы по сооружению БН-800 были возобновлены в 2006 г. Первая критичность на реакторе была достигнута 27 июня 2014 г. Энергоблок №4 с реактором БН-800 был впервые включён в единую энергосистему страны 10 декабря 2015 г., 31 октября 2016 г. энергоблок был введен в промышленную эксплуатацию. Реактор начал работать с использованием, так называемой гибридной активной зоны, в которой основную долю составляют тепловыделяющие сборки (ТВС) с урановым топливом – 84% и 16% – ТВС с МОХ-топливом, изготовленным на опытных производствах ПО «МАЯК» и ОАО «ГНЦ НИИАР». Перевод активной зоны на полную загрузку МОХ-топливом осуществлен в 2022-2023 гг. МОХ-топливо изготавливается на сооруженном для этой цели заводе на ГХК.

Реактор БН-800 включает в себя все основные принципиальные технические решения, которые были реализованы в БН-600.

(с) ФЭИ г. Обнинск